这位傀儡将军虽不敢公开反抗三好长庆，却也不想彻底得罪细川晴元，只能以需与幕臣商议为由，迟迟不发布檄文。双方在桂川两岸对峙十余日，谁也没有率先发起进攻。细川晴元虽有八千兵力，却多是临时集结的豪族武装，战力参差不齐且缺乏粮草补给。
三好长庆同样因河内、纪伊的局势不稳，不敢贸然分兵，担心后方出现变故。近畿的空气仿佛凝固了，所有人都在等待着打破平衡的那一天。而这一天，最终因幕府内部的分裂而提前到来。
细川晴元的对峙像一把钥匙，打开了幕府内部反三好派的潘多拉魔盒。京都幕府的幕臣原本就分为两派，亲三好派多是被三好长庆扶持的幕臣，或是与三好家有联姻关系的贵族；反三好派多是足利义藤旧臣，或是不满三好家架空幕府奉公众（将军直属武士）。
此前因三好家势大，反三好派一直不敢公开反对，如今见细川晴元率军来袭，终于找到了发难的机会。奉公众上野信孝出身武士世家，早年跟随足利义藤流亡近江，对三好家专权深恶痛绝。
上野信孝在幕府会议率先发难：“细川晴元虽有叛乱之嫌，却也是为了恢复细川家正统；三好长庆擅自废立家督、架空幕府，才是真正的乱臣贼子！如今细川军已至京郊，正是我们联合他驱逐三好长庆的好时机，若错过此次机会，幕府或将永远沦为三好家的傀儡！”
他的话立刻得到了其他反三好派幕臣的响应，奉公众二阶堂盛义接着说道：“上野大人所言极是！三好家如今连河内、纪伊都无法实际掌控，可见其统治早已不稳。只要将军下令，我们愿率军配合细川晴元，定能将三好长庆赶出京都！”
“荒谬！”亲三好派领袖、幕府奉行伊势贞孝立刻出言反驳，“细川晴元不过是丧家之犬，麾下兵力多是乌合之众，岂能与三好家抗衡？上野大人此举，分明是想借细川晴元之手，颠覆幕府！如今三好家掌控近畿十国，兵力强盛，若与之为敌，不仅幕府会被毁灭，京都也会陷入战火，你们担得起这个责任吗？”
伊势贞孝的话得到了亲三好派幕臣的支持，和气常明说道：“伊势大人说得对！三好长庆虽说有架空嫌疑，却也维持了近畿的稳定。若驱逐三好家，近畿将陷入混战，到时候受苦的还是我们。依我之见，应当立刻驱逐上野信孝等人，向三好长庆表忠心，并助他平定细川叛乱。”
两派幕臣在会议上争论不休，整个幕府大殿乱成一团。足利义藤坐在将军宝座上，脸色苍白，双手紧握扶手。他既想借助反三好派与细川晴元的力量摆脱三好家控制，又害怕失败后遭到三好长庆报复；既想安抚亲三好派保住将军之位，又不想彻底得罪反三好派。
最终的结果，足利义藤只能选择沉默，任由两派争论，既不支持反三好派，也不驱逐他们，让幕府陷入了前所未有的瘫痪状态。幕府分裂给了三好长庆沉重打击，原本他借着将军名义号令近畿豪族，如今幕府内部自乱阵脚，他的合法外衣暂时失效。
近畿豪族看到连这样的幕府都无法统一立场，纷纷对三好家的统治能力产生怀疑。连这样的幕府都掌控不了，三好家的霸权还能维持多久？有的豪族开始暗中与细川晴元联络，有的则减少了向三好家缴纳的贡赋，甚至有摄津国土豪公开拒绝三好家征兵命令。
三好长庆站在伏见城天守阁上，望着远处桂川对岸的细川军营地，又看向京都城内隐约的灯火，心中第一次生出力不从心的感觉。游佐长教的死、河内纪伊的失控、六角家的转向、细川晴元的反扑、幕府的分裂……
这一连串变故像一张网将他紧紧缠住，他曾经以为，掌控近畿十国，架空幕府将军，就是天下人的雏形。可如今才明白，没有稳固的统治基础，没有统一的内部立场，再大的霸权也不过是空中楼阁。
暮色渐浓，暑气消散，可三好长庆的心头却越来越沉重。他清楚的知道，天文二十年的这场危机，只是三好家霸权的第一次裂痕。若不能尽快解决，未来还会有更多的细川晴元站出来，挑战他的统治。
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