然而随着克隆人战争的不断推进，独立星系邦联的科研和工业核心逐渐朝着黎明星球转移，这让波格尔-下等人感受到了极大的威胁。而最重要的行动，就是黎明星球占领克里斯托夫西斯星球，以及在塔图因星球保持了强大的影响力。
这两颗星球都临近吉奥诺西斯星球，从而让波格尔-下等人坐立难安。
当杜库伯爵和达斯-西迪厄斯渐行渐远之后，波格尔-下等人认为这场战争已经必然失败，所以他和有着同样看法的技术联盟大工头沃特-坦伯秘密勾结起来，悄悄地倒向了达斯-西迪厄斯这一边。
吉奥诺西斯人实际上本身就是技术联盟的重要成员，所以波格尔-下等人和沃特-坦伯之间的关系一直就很好。
正好在这时候，银河共和国的舰队已经第二次进攻吉奥诺西斯星球，并且在安纳金-天行者、欧比旺-肯诺比的带领下杀入星球的机器人工厂，摧毁了他们的超级坦克研发中心。
绝地武士带领下的共和国舰队势如破竹的力量终于让波格尔-下等人以及沃特-坦伯下定了决心，他们秘密向银河共和国的议长帕尔帕廷投降。
而帕尔帕廷也在原力当中看到了他们内心的恐惧，威胁他们要把技术联盟的斯卡科星球以及吉奥诺西斯星球犁为平地。两人在极度惊恐之下，接受了帕尔帕廷提出的一切条件。
这个条件，就是帮助他完成DS-1战斗空间站的建造。
在这时候，吉奥诺西斯人的内部也出现了问题。那些曾经被波格尔-下等人击败的上等种姓开始蠢蠢欲动，准备推翻波格尔-下等人的统治，重塑吉奥诺西斯人的种姓制度。
遭到战争削弱的波格尔-下等人担心自己无力应对上等种姓的反扑，于是在达斯-西迪厄斯的蛊惑下，作出了一个非常残酷的决定——他打算绑架卡琳娜大帝（Queen Karina the Great），然后再让银河共和国的舰队轰炸吉奥诺西斯星球，将星球彻底摧毁，同时也消灭绝大部分的吉奥诺西斯人。
在这之后，他就能控制卡琳娜大帝，以他自己为核心，重建吉奥诺西斯人的社会，这样一来，他就成了整个种族至高无上的统治者，再也没人能够撼动他的地位。
波格尔-下等人的行动成功了一半，他成功绑架了卡琳娜大帝，并且将她带去了塔拉西亚星球，孵化出大量的劳工种姓吉奥诺西斯人，为达斯-西迪厄斯秘密建造DS-1战斗空间站。
然而，达斯-西迪厄斯却并没有兑现他的承诺。虽然当黎明星球退出战争之后，独立星系邦联迅速土崩瓦解，失去了卡琳娜大帝的吉奥诺西斯人无法得到人口补充，损失极为惨重。
但是银河帝国却忌惮黎明王国在银河系南境的力量，尤其是克里斯托夫西斯星球在侧翼的威胁，因此他们并没有摧毁吉奥诺西斯星球，而是把精力集中在赖诺思星球，准备重建第14军身上。
同时，那些群龙无首的吉奥诺西斯人在走投无路之下，只能求助于唐骁。唐骁立刻就明白，这个阴谋就是达斯-西迪厄斯为了推进死星的建造而做的，虽然做法和原剧情不同，但是目的却是完全一样。
于是唐骁开始出资支持这些吉奥诺西斯人，他们也开始团结在一个叫做甘佐-道索（Gizor Dellso）的吉奥诺西斯人工程师周围，开始了漫长的寻找种族女王的道路。
甘佐-道索是属于工程师种姓，是一个‘中等人’。但是由于工程师种姓需要许多的创新工作，因此这个种姓的蜂群意识非常淡薄，甘佐-道索又是一个天赋异禀，意志坚强的人，他很早就成为了吉奥诺西斯人的总工程师之一。
他为贸易联盟设计制造B-1战斗机器人的中枢控制系统的工作。B-1战斗机器人有一个紧急关机指令，这个指令系统要求可以通过一个命令将所有的B-1战斗机器人全部关机。
这最初是贸易联盟担心机器人叛乱而做的反制手段，要求在瞬间把整个银河系范围内所有的B-1战斗机器人关机。所以这个系统看起来简单，实际上无比复杂和庞大，而甘佐-道索很好的完成了工作，这套系统叫做信号超驰系统（Signal override apparatus）。
在原剧情当中，贸易联盟总督纽特-冈雷在达斯-西迪厄斯的命令下，利用信号超驰系统关闭了所有的独立星系邦联的机器人大军，让战争瞬间结束。但是甘佐-道索却并不甘心接受失败，他重启了许多战斗机器人，并且在穆斯塔法星球掀起反旗。
甘佐-道索这时候也表现出了优秀的指挥能力，他指挥机器人军团给银河帝国造成了极大的麻烦。
最后经过数年的艰苦斗争之后，他终于被达斯-维达杀死在穆斯塔法星球，他也是独立星系邦联抵抗到最后的将军之一。
而在这个宇宙，由于纽特-冈雷选择了抵抗到底，并没有关闭战斗机器人，所以甘佐-道索也并没有站出来反抗银河帝国。
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