黑暗中的脚步声越来越近，艾丽斯将艾伦护在身后，握紧星海能量武器对准通道入口。昏暗中，几道高大的身影逐渐显现 —— 是暗物质文明的 “傀儡士兵”，他们的身体一半是机械改造部件，一半覆盖着暗物质能量形成的铠甲，手中的暗物质步枪正散发着冰冷的光芒。
“小心他们的武器，” 艾伦虚弱地提醒，“暗物质子弹能穿透普通能量护盾。” 话音刚落，傀儡士兵已扣动扳机，暗蓝色的子弹直奔艾丽斯而来。她凭借敏捷强化能力侧身躲闪，子弹击中身后的金属墙壁，瞬间留下一个冒着青烟的孔洞。艾丽斯趁机反击，星海能量武器的光束击中一名傀儡士兵的胸口，对方的机械部件瞬间短路，瘫倒在地。
但傀儡士兵数量远超预期，很快就将两人包围。艾丽斯且战且退，逐渐被逼到能量补给装置旁。就在这时，艾伦突然抓住她的手腕，将她的手按在补给装置的核心接口上：“用星海能量激活它…… 装置会释放…… 反暗物质脉冲……” 艾丽斯立即注入星海能量，装置表面的暗蓝色光芒逐渐转为淡蓝，随后发出一阵强烈的脉冲波。
脉冲波扩散的瞬间，周围的傀儡士兵纷纷停滞动作，机械部件开始冒烟，暗物质能量铠甲逐渐消散。艾丽斯趁机带着艾伦躲到控制台后，看着傀儡士兵一个个瘫倒在地，松了口气。“这装置…… 原本是暗物质文明…… 用来压制失控傀儡的，” 艾伦靠在控制台旁，呼吸急促，“现在只能…… 暂时瘫痪他们。”
两人刚喘口气，控制室的另一侧突然传来金属门开启的声音。艾丽斯立即举起武器，却看到一个穿着白色实验服的外星生物走了出来 —— 对方有着细长的四肢和透明的头部，头部内隐约能看到发光的神经脉络。“别紧张，” 外星生物开口，声音通过星核系统的实时翻译传入艾丽斯耳中，“我是被暗物质文明俘虏的‘莱特星科研者’，名叫科恩。”
科恩看出艾丽斯的警惕，主动举起双手：“我知道你们在找什么，暗物质文明在这里挖掘星海文明的遗迹，他们想获取星海文明的‘空间折叠技术’，用来建造跨星系的战争通道。” 他带领两人穿过另一扇金属门，进入一间更大的密室，密室中央悬浮着一块巨大的星海文明遗迹碎片，碎片周围布满了暗物质探测设备。
“艾伦被改造时，我曾参与过部分实验，” 科恩指着遗迹碎片，“暗物质文明发现，只有用‘星海能量’才能激活遗迹碎片，所以他们一直想抓住拥有星海能量的人类，比如你和林夜。” 艾丽斯看向艾伦，发现他正盯着遗迹碎片，眼神复杂 —— 碎片散发的能量波动，与他体内残留的暗物质能量产生了微弱的共鸣。
科恩突然压低声音：“暗物质文明的主基地就在这片区域的核心，那里关押着更多像我一样的俘虏，还有一台‘空间折叠发生器’的原型机。如果他们成功激活发生器，就能在短时间内调动百万级别的军队，进攻地球联邦。” 他从口袋里掏出一块小型数据盘，递给艾丽斯：“这是我偷偷复制的主基地防御图和发生器的弱点数据，你们必须尽快把它交给林夜。”
就在这时，控制室的警报突然响起，红色的警示灯照亮整个密室。科恩脸色骤变：“暗物质文明的巡逻队来了！他们发现傀儡士兵失控了！” 他快速打开一扇隐蔽的通风口，“你们从这里走，通风口能通往基地外围的小型飞船停泊点，我会想办法拖延时间。”
艾丽斯搀扶着艾伦钻进通风口，回头看向科恩：“你怎么办？”“我自有办法，” 科恩笑着挥手，“记住，一定要毁掉空间折叠发生器，否则整个星海文明都会有危险。” 通风口的盖子缓缓关闭，隔绝了外面的警报声和脚步声。
通风管道内狭窄黑暗，只能容一人弯腰前行。艾伦的机械义眼在黑暗中发出微弱的光芒，为艾丽斯照亮前方的路。“科恩…… 可能活不了了，” 艾伦的声音带着愧疚，“暗物质文明对叛徒的惩罚…… 很残酷。” 艾丽斯握紧手中的数据盘，坚定地说：“我们会完成他的心愿，毁掉发生器，救出所有俘虏。”
两人在通风管道内爬行了约十分钟，终于听到外面传来飞船引擎的声音。艾丽斯小心地打开通风口的盖子，发现下方是一个小型停泊点，停泊点内停着三艘暗物质小型飞船，周围只有两名傀儡士兵在巡逻。她示意艾伦待在管道内，自己悄悄跳下，利用环境掩护接近傀儡士兵，快速解决掉他们。
艾丽斯将艾伦从通风管道中扶下来，两人登上其中一艘飞船。她尝试启动飞船，却发现控制台需要暗物质能量授权。“让我来，” 艾伦伸出机械手臂，将手臂上的能量接口贴近控制台，暗蓝色的能量注入后，飞船成功启动。“我们现在…… 去哪里？” 艾丽斯看着控制台屏幕上的星图，问道。
艾伦调整飞船方向，指向暗物质区域的核心方向：“去主基地，我知道空间折叠发生器的具体位置，我们可以先毁掉它，再等林夜的支援。” 飞船缓缓升空，朝着主基地的方向飞去。艾丽斯看着舷窗外逐渐密集的暗物质战舰，握紧了手中的星海能量武器 —— 一场新的战斗，即将开始
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