主舰返航途中，林夜接到各区域清理小队的汇报：北极总部废墟周边的残余虚空生物已基本肃清，全球范围内的零点组织据点也在联盟军队的突袭下接连沦陷。秦雨将整理好的战损报告递到林夜面前，屏幕上的数据显示，联盟军队伤亡不足千人，而零点组织的核心成员除赵凯外已全部被歼灭或俘虏。
“赵凯的行踪还没找到吗？” 林夜手指停在报告末尾的 “残余威胁” 一栏，眉头微蹙。秦雨调出星核系统的探测记录：“他在聚合炸弹爆炸前通过空间传送门逃离，目前只能探测到微弱的虚空能量残留，无法确定具体位置。不过，我们在苏芮的随身终端里发现了一份加密文件，里面提到零点组织在南美雨林有一个‘后备基地’，赵凯很可能逃去了那里。”
林夜立即下令：“让南美区域的联盟军队加强警戒，同时派艾丽斯带领先锋小队前往南美雨林探查，务必找到后备基地的位置。另外，通知全球各势力，继续清理零点组织的残余成员，不能给他们死灰复燃的机会。”
艾丽斯接到命令后，立即带领小队乘坐运输机前往南美。与此同时，林夜带领主舰返回前进基地，刚落地就看到李将军带着西部军政府的官员迎了上来：“林统帅，我们在清理北极总部废墟时，发现了一个隐藏的地下仓库，里面囤积了大量虚空能量武器和实验资料，还有几十名被囚禁的幸存者，我们已经将他们解救出来。”
林夜跟着李将军前往地下仓库，仓库内整齐堆放着虚空能量步枪、手雷等武器，实验资料上详细记录了零点组织研究虚空生物和强制觉醒药剂的过程。被解救的幸存者大多身体虚弱，医护人员正在为他们进行检查和治疗。“这些资料和武器交给科研团队研究，或许能为我们研发反虚空技术提供帮助。” 林夜对着秦雨说道，秦雨立即安排人手将资料和武器运回主舰的科研舱。
当天下午，南美雨林传来消息：艾丽斯小队找到了零点组织的后备基地，基地隐藏在一处瀑布后面的山洞中，赵凯正在里面试图启动一台小型虚空能量发生器。林夜立即下令：“主舰全速前往南美，支援艾丽斯小队！务必阻止赵凯，不能让他再次打开虚空裂缝！”
主舰抵达南美雨林上空时，艾丽斯小队正与基地的守卫激战。赵凯已启动虚空能量发生器，山洞周围开始出现微弱的紫色能量波动。“立即发起突袭！” 林夜下令，主舰的虚空能量炮对准山洞入口，淡蓝色光束瞬间摧毁了守卫的防御工事。艾丽斯带领小队趁机冲进山洞，朝着发生器的位置冲去。
赵凯见联盟军队发起总攻，疯狂地加大发生器的能量输出：“就算我死，也要让这里变成虚空生物的乐园！” 他操控虚空能量形成护盾，抵挡小队的攻击。林夜从主舰空降，激活星海之心的能量，淡蓝色光束击穿赵凯的护盾，击中他的胸口。
赵凯喷出一口紫色血液，倒在发生器旁。他挣扎着想要按下发生器的自爆按钮，艾丽斯及时冲上前，用能量匕首刺穿他的手腕。“你输了。” 艾丽斯的声音冰冷，赵凯看着逐渐逼近的联盟士兵，眼中满是不甘，最终失去了生命体征。
林夜走上前，关闭了虚空能量发生器，山洞周围的紫色能量波动逐渐消散。“清理基地的残余物资，将所有虚空能量设备带回主舰销毁。” 林夜对着队员下令，随后对着通讯器说道：“秦雨，通知全球各势力，零点组织的核心成员已全部覆灭，后备基地也已被摧毁，零点组织正式宣告覆灭。”
通讯器那头传来秦雨的声音：“收到！另外，科研团队在分析苏芮的尸检报告时发现，她体内有虚空文明植入的‘意识芯片’，或许能通过芯片获取更多关于虚空文明的情报。” 林夜点头：“让科研团队加快研究进度，我们需要尽快了解虚空文明的真实实力，为未来的对抗做好准备。”
当所有清理工作完成后，林夜带领主舰返回前进基地。基地内，联盟军队的士兵们欢呼雀跃，庆祝这场胜利。林夜站在基地的了望塔上，看着远处的夕阳，心中明白，零点组织的覆灭只是一个开始，人类文明即将面临的，是更加庞大的虚空文明威胁。就在这时，主舰的星核系统突然弹出警报：【检测到来自宇宙的未知能量信号，正在快速靠近地球！】
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