对外开放政策的成功推行，让明朝的经济发展进入了一个新的高峰。京城、南京、广州等大城市日益繁华，商业活动频繁，人口数量大幅增加。百姓的生活水平也得到了显着的提高，安居乐业，社会稳定。
朱厚熜并没有因此而放松对朝政的管理。他深知，“创业难，守业更难”。要想让大明的中兴之治能够长久延续下去，必须继续加强改革，完善制度。
他首先将目光放在了官僚制度的改革上。虽然经过之前的整顿，官场风气得到了明显改善，但仍然存在一些问题。比如，官员的考核制度还不够完善，导致一些官员尸位素餐，不作为、乱作为；官员的升迁制度也存在一些弊端，导致一些有才能的官员得不到重用。
于是，朱厚熜召见了张璁、桂萼等大臣，与他们商议官僚制度改革的事宜。“诸位爱卿，现在官场风气虽然有所改善，但仍然存在一些问题。朕想进一步改革官僚制度，完善官员的考核和升迁制度，选拔更多有才能、能干事的官员。你们有什么好的建议？”
张璁说道：“陛下，臣以为，要完善官员的考核制度，应该实行‘定期考核，量化评分’的方式。每年对官员进行一次考核，考核内容包括政绩、品德、能力等方面，根据考核结果进行量化评分。对于考核优秀的官员，予以提拔重用；对于考核不合格的官员，予以罢免或降职。这样可以有效地激励官员积极进取，提高工作效率。”
桂萼也附和道：“陛下，张大人所言极是。除此之外，臣还建议改革官员的升迁制度。现在的升迁制度，过于注重资历，导致一些年轻有为的官员得不到重用。应该打破资历的限制，以能力和政绩为主要标准，选拔有才能的官员担任要职。同时，还应该加强对官员的培训，提高官员的综合素质。”
朱厚熜点了点头，两人的建议非常全面。“好，就按照你们的建议去做。”他说道，“朕下令，由吏部牵头，制定详细的官员考核和升迁制度，尽快推行。同时，设立专门的培训机构，负责对官员进行培训。”
“臣等遵旨！”大臣们连忙躬身应道。
很快，新的官员考核和升迁制度正式推行。新制度的推行，有效地激励了官员的积极性，提高了工作效率。一批有才能、有政绩的官员得到了提拔重用，官场风气进一步改善。同时，官员培训机构的设立，也提高了官员的综合素质，为明朝的发展提供了有力的人才支持。
接下来，朱厚熜又将目光放在了农业生产上。农业是明朝的根本，只有农业发展了，国家才能稳定。虽然之前推行了均田制，限制了土地兼并，但农业生产的技术水平还比较落后，粮食产量还有很大的提升空间。
他召见了户部尚书和工部尚书，与他们商议农业改革的事宜。“诸位爱卿，农业是国家的根本。现在虽然推行了均田制，但农业生产的技术水平还比较落后，粮食产量还有很大的提升空间。朕想进行农业改革，推广先进的农业技术，提高粮食产量。你们有什么好的建议？”
户部尚书说道：“陛下，臣以为，要提高粮食产量，首先要推广先进的农业技术。比如，推广新的农作物品种，如玉米、红薯等，这些农作物适应性强，产量高，可以有效提高粮食产量。其次，要兴修水利，改善农业生产条件。水利是农业的命脉，只有兴修水利，才能保证农业生产的顺利进行。”
工部尚书也附和道：“陛下，户部尚书所言极是。除此之外，臣还建议，加强对农民的技术指导，派专业的农业技术人员到农村去，指导农民种植农作物，提高农民的种植技术水平。同时，还可以设立专门的农业科研机构，研究新的农业技术和农作物品种。”
朱厚熜点了点头，说道：“好，就按照你们的建议去做。朕下令，由户部和工部牵头，负责农业改革的相关事宜。尽快引进玉米、红薯等新的农作物品种，在全国范围内推广；加大对水利建设的投入，兴修水利工程；设立农业技术指导机构和农业科研机构，提高农业生产的技术水平。”
“臣等遵旨！”户部尚书和工部尚书连忙躬身应道。
很快，农业改革正式推行。明朝政府从海外引进了玉米、红薯等新的农作物品种，在全国范围内进行推广。这些农作物适应性强，产量高，很快就得到了农民的广泛认可。同时，明朝政府加大了对水利建设的投入，兴修了大量的水利工程，改善了农业生产条件。农业技术指导机构和农业科研机构的设立，也提高了农民的种植技术水平，促进了农业生产的发展。
经过
数年的深耕细作，农业改革的成效愈发显着。玉米、红薯在南北各地广泛种植，即便是贫瘠的山地、丘陵也能获得丰收，全国粮食产量较之前提升了三成有余，彻底扭转了明朝常年缺粮的困境。各地官府设立的义仓储备充盈，即便遭遇水旱灾害，也能及时开仓放粮，保障百姓不致流离失所。水利工程的兴修更是惠及万千农户，黄河、淮河沿岸的堤坝得到加固，江南的圩田系统愈发完善，昔日易涝易旱之地，如今皆成鱼米之乡。
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