与此同时，各层通道里，起义的士兵和平民与闻讯赶来的“哨兵”部队发生了激烈冲突。战斗在狭窄的通道、生活区广场和仓库中展开，每一寸土地都沾染了鲜血。起义者凭借人数优势和对地形的熟悉，以及突如其来的士气，一度占据了上风。但“哨兵”部队装备精良、训练有素，战斗异常惨烈。
最危险的是E区。索菲亚的小队刚刚潜入外围，就触发了警报。实验室的自动防御系统启动，数只处于半控制状态形态扭曲的“融合实验体”被释放出来，它们兼具变异生物的狂暴和部分机械增强，极其难缠。更可怕的是，总监本人似乎提前有所警觉，竟然不在指挥中心，而是出现在了E区深处的安全屋，并通过备用系统，试图启动实验室的自毁程序，并释放所有库存的高危样本！
千钧一发之际，索菲亚小队付出了两人牺牲的代价，强行炸毁了主能源管道和样本库的低温维持系统。剧烈的爆炸和管道破裂引发的连锁反应，瘫痪了E区大部分功能，也阻断了自毁程序的完全执行。
而指挥中心方向，重伤的李博士终于在被炸毁的主控台残骸下，找到了躲藏的总监“代达罗斯”。这位曾经高高在上、意图驾驭“归墟”的狂人，此刻衣衫不整，眼神涣散，手中紧紧抓着一个类似起爆器的红色东西。
“结束了，代达罗斯。”李博士用枪指着他，鲜血从手臂不断滴落。
总监看着他，忽然古怪地笑了：“结束？不，李，这只是开始……‘归墟’会证明我是对的……你们……都会成为它的一部分……”他猛地按下了手中的按钮！
然而，什么也没发生。除了远处E区传来的又一声闷响，那是备用起爆装置被索菲亚小队破坏的结果。
总监愣住了，随即像被抽空了所有力气般瘫软下去，口中喃喃着无人能懂的话语。
随着指挥中心被控制、E区被瘫痪、各层“哨兵”部队在起义军内外夹击和“希望号”在地堡外部空域进行的威慑性巡航下逐渐丧失斗志或投降，持续了将近十个小时的激烈内乱，终于以起义军的惨胜告终。
清点结果，起义军和平民伤亡超过八百人，“哨兵”部队大部被歼，少数投降。总监代达罗斯被俘，E区实验室被彻底封闭，等待后续处理。地堡满目疮痍，但一种混杂着悲痛与希望的情绪，开始在幸存者中蔓延。
三天后，伤势未愈但坚持出席的汉森将军，与李博士、米勒、索菲亚以及新推选出的平民代表一起，在曾经的总监办公室，如今被简单布置成临时议事厅与“希望号”的赵刚，以及龙宫总部的林薇，举行了三方会谈。
李博士代表新生的伊甸地堡管理委员会，正式宣布：彻底废除总监代达罗斯的“升华计划”及一切相关研究；在龙宫技术监督下进行销毁所有“融合实验体”及高危样本；承诺遵循基本人道原则，重建地堡社会秩序；并申请以平等成员身份，加入龙宫全球抵抗联盟，共享情报、技术，共抗“归墟”。
林薇代表龙宫联盟接受了申请，并承诺将提供紧急人道主义援助和技术支持，帮助地堡修复创伤，恢复基本生产，并共同建立针对孢子平原及丹佛节点的长期监控与防御体系。
赵刚则代表北美前线，与新的地堡领导层具体商讨了防务交接、联合巡逻，以及针对“斩首行动”后孢子平原新动向的应对策略。
会议结束时，所有人都精疲力尽，但眼中都有了一丝光亮。那不再是总监眼中那种想要驾驭毁灭的疯狂火焰，而是劫后余生、携手求存的微弱但坚韧的星火。
“伊甸”这个名字，曾经是讽刺，是囚笼，是疯狂野心的试验场。如今，历经背叛、流血与革命，它终于有了一丝向着真正“希望之地”蜕变的可能性。尽管前路依然布满孢子与荆棘，尽管全球的“归墟”阴影更加浓重，但至少在这里，人类重新夺回了对自己命运的选择权，站在了同一面旗帜下。
北美战线，在付出了难以想象的代价后，终于初步稳定下来。但所有人都知道，这稳定犹如建立在尚未冷却的火山口上，真正的考验，或许才刚刚开始。而“伊甸新生”的故事，将成为龙宫联盟在全球抵抗画卷中，浓墨重彩而又充满警示的一笔。
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