另一方面，崔忠献也面临着奴隶、农民起义的威胁。他先是采用武力平定起义，然后加以安抚政策。对于一些起义领袖人物，他授以官衔，把他们原本所属的“部曲”、“乡”或强制劳动区，合并入常规的县制。这些做法不仅平息了奴隶、农民的起义，还进一步巩固了崔忠献在高丽王朝的统治基础。
晚年去世：权臣的终结与家族的延续
贞佑七年（1219年）九月二十日，崔忠献在安兴里私邸去世，享年七十一岁。去世前夕，崔忠献上表辞职，并还赐姓。当时月犯荧惑，日官上奏将有贵人死去。崔忠献似乎预感到了自己的命运，他召集数十名乐工全日奏乐，“至夜三鼓，乐未阕，果死”。死后得谥“景成”，功臣号达138字之多。其丧礼亦极其盛大，“百官缟素会葬，秘器、羽葆、鼓吹、旗常拟于王者”。十二月，高丽高宗又为他辍朝三日。
据《高丽史》的记载，崔忠献身患重疾，即将离世时预料身后可能有人作乱，便叮嘱儿子崔瑀（崔怡）切勿前来看望。果然，崔忠献所宠信的将军崔俊文与池允深、柳松节、金德明密谋铲除崔瑀，并不断促请崔瑀到病重的崔忠献家中看望。崔瑀遵照父亲叮嘱，没有上当。后来金德明把阴谋告诉崔瑀，让他做好准备。而崔俊文、池允深仍不明就里，亲自上门找崔瑀，欺骗他“公（崔忠献）疾革，宜速往候”。崔瑀见势即捉拿二人，加以惩处，平息了这次危机。
崔忠献去世后，崔瑀积极收买人心，革除崔忠献在世时的弊病，稳定了统治。他在自己的私宅里设立“政房”，令权力更加稳固。崔忠献所开创的“崔氏政权”在崔瑀的延续下得以延绵下去。
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