天正十七年（1589年），芦名盛重再度出兵须贺川，正当恶战之时，突然重臣猪苗代盛国谋叛，引导伊达军直插主城黑川。盛重急忙挥兵赶回，六月五日，他在磐梯山的摺上原撞上伊达军，于是展开大战——这就是着名的摺上原合战，乃是继人取桥合战后，伊达政宗一生中的第二场关键性战役。
摺上原合战中，参战的芦名军约七千人，伊达军则为五千人。战斗首先在芦名方大将富田将监和刚投顺伊达方的猪苗代盛国之间展开。恶战良久，因为芦名军背着西风朝前猛冲，猪苗代盛国大败后退，伊达方二番队片仓景纲急往支援，依然处于下风。就在危急关头，风向突然反转，东风强烈，吹得芦名军士卒难以睁开双眼，伊达政宗趁机亲率铁炮队从侧面射击，挽回了败局。芦名军中一部分不满主家倒向常陆佐竹氏的部队首先败走，最终导致全面崩溃。
此战，芦名氏死伤两千五百人，当主盛重带着十三骑逃回本城会津黑川城，并于十日晚又逃出黑川城，往佐竹氏控制的常陆国遁走。次日，伊达政宗进入黑川城，获得了战役的最后胜利。南陆奥百年强藩芦名氏就此灭亡。如果芦名盛重能再多抵抗一阵子，或许还能使家族苟延残喘下去，但历史没有如果。
五、家族分裂
伊达政宗在摺上原合战中击败芦名氏后，虽然巩固了在奥州的统治地位，但也引发了更大的危机。芦名氏的灭亡触怒了其背后的总后台丰臣秀吉。天正十九年（1590年），秀吉向上杉和佐竹等东国大名下达了讨伐伊达氏的命令。面对如此严峻的形势，伊达政宗采取了两面策略：一方面派使者上京，解释说并无与关白为敌之意，灭亡芦名氏只是为了报父仇；另一方面则暗中联络小田原的北条氏，准备先攻破常陆佐竹氏，再谋求更大的发展。
然而，伊达政宗的犹豫不决导致了伊达家中的分裂。政宗的母亲保春院一直不喜欢长子政宗，却偏爱次子小次郎竺丸。此外，政宗的舅舅最上义光也将政宗视为眼中钉肉中刺。最上义光对伊达氏早有吞并之心，更重要的是，在最上义守和义光的争斗中，政宗站在义守一边。义守失败后，最上义光继承了家督之位，对政宗的仇恨更深，暗中撺掇其妹发动政变，废黜政宗的家督之位。
丰臣秀吉的关东攻略成为保春院和政宗间矛盾激化的导火索。政宗的犹豫不决让保春院认为他会毁了伊达家，甚至可能牵累到舅家最上氏。因此，保春院计划暗杀政宗，代之以次子竺丸。
天正十七年（1589年）六月，伊达政宗进入会津黑川城，并准备将居城从米泽移至此处，表现出向南大举侵攻的势头。随后，他又臣服了白河、石川、岩城等豪族，灭亡了二阶堂氏，势力继续膨胀。十一月，丰臣秀吉发布小田原征伐令。
天正十八年（1590年）元月，丰臣秀吉命令奥羽诸侯小田原参阵，意图在扫荡关东的同时，一举平定东北地区。伊达政宗虽然口头答应，但一再拖延动身的时间，这自然引起了保春院的担忧。三、四月间，保春院以送行为名，带着竺丸从米泽城来到黑川城，居住在西馆中。四月五日，政宗来到西馆向母亲辞行，准备次日动身前往觐见秀吉。然而，由于家中分裂，政宗的行程一再耽搁，直到五月九日才离开黑川城。
此时，关东各地正在激战，伊达政宗被迫绕道越后、信浓，兜了一个大圈子，才在六月五日来到小田原附近的秀吉本阵中。此时，后北条氏的河越、江户诸城已降，钵形、八王子等城也即将陷落，胜负大势已定。在这种情况下，政宗的到来显得过于迟缓，引起了秀吉的极大不满。秀吉认为政宗有意拖延，准备杀掉政宗，并在灭亡小田原北条氏后挥师北上，彻底吞并伊达领地。
然而，伊达政宗的聪明才智和政治手腕在此关键时刻发挥了作用。他通过各种手段向秀吉表明了自己的忠诚，并承诺全力支持丰臣政权。最终，秀吉接受了政宗的效忠，没有立即采取极端措施。伊达政宗的这一举动不仅保住了伊达家的领地，也为他日后的发展留下了空间。
这次危机虽然暂时化解，但伊达家内部的分裂问题并未完全解决。政宗的母亲保春院和弟弟竺丸的反对声音依然存在，这也促使政宗在后续的治理中更加谨慎，努力平衡各方利益，巩固自己的统治地位。
六、臣服丰臣
天正十九年（1590年）二月，伊达政宗刚刚回到米泽城不久，丰臣秀吉就攻灭了后北条氏，开始对奥羽地区的领国势力进行重新分配。未能及时参阵的大崎、葛西等大名的领土被剥夺，这引发了这些家族遗臣的不满。同年十月，这些家族的遗臣发动了一揆（民众起义）。次年年初，讨伐军总大将蒲生氏乡向秀吉密报，一揆中有人使用了政宗的旗帜和指物，并且他还搜获了一封政宗煽动一揆的书信。
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