道光帝采纳了穆彰阿的意见，决定罢免林则徐，并任命琦善为两广总督。然而，琦善采取的妥协政策并未能平息英军的怒火，战争继续升级。1841年，清廷派遣奕山、奕经分别前往广东和浙江指挥作战，但均未能阻止英军的攻势，反而遭受了严重的失败。
到了1842年，英军进一步威胁到了长江流域的安全，道光帝意识到继续战斗只会带来更大的损失。于是，他命令伊里布、耆英、牛鉴等人与英军进行谈判。最终，《南京条约》签订，条约规定中国需向英国支付巨额赔款，并开放广州、厦门、福州、宁波、上海五个港口作为通商口岸。与此同时，美国和法国也趁机与中国签订了类似的不平等条约。
穆彰阿在整个过程中，一直主张避免与英军发生正面冲突，并积极推动议和进程。尽管他的立场在当时受到了一些人的批评，认为他对国家利益的牺牲过于轻易，但在道光帝看来，穆彰阿的做法符合他希望尽快结束战争的愿望。因此，在整个道光年间，穆彰阿依然保持着皇帝的信任和重用。
四、晚年
穆彰阿在晚年的生活中，仍然活跃于清朝的政治舞台上，尤其是在教育和文化领域。他主持了多次乡试和会试，这不仅为国家选拔了大量人才，也使得他的门生遍布各地。此外，他还参与了各种重要的考试评审工作，如覆试、殿试和朝考，这进一步巩固了他在文人官僚中的威望。
作为编纂国史、玉牒、实录等史料的总裁官，穆彰阿的工作不仅仅是整理和记录历史，更是在塑造官方的历史叙述。这些工作为后世提供了宝贵的历史资料，同时也反映了他在文化和学术上的深远影响。他的门生和追随者众多，形成了所谓的“穆党”，这股力量在一定程度上影响了当时的政治格局。
然而，好景不长，1850年，随着道光帝的逝世，咸丰帝即位，穆彰阿的政治命运发生了剧变。咸丰帝对穆彰阿的厌恶早在他还是皇子时就已经显现出来，他认为穆彰阿是一个阻碍改革、阻碍国家进步的人物。在咸丰帝看来，穆彰阿的“保位贪荣”已经严重妨碍了贤才的提拔，从而损害了国家的利益。因此，咸丰帝即位不久后，便下达了对穆彰阿的严厉指责，并将其革职，永不叙用。
这一决定得到了广泛的支持，诏令一下达，便在全国范围内引起了一片欢呼之声。对于许多人来说，这标志着一个时代的结束，也是对穆彰阿长期以来政治行为的一种清算。
尽管被革职，穆彰阿并未完全退出公众视野。1853年，太平天国运动正盛，清廷面临巨大的军事压力，需要大量的军费支持。在这种情况下，穆彰阿通过向朝廷捐纳钱物的方式，为补充军饷做出了贡献。为此，朝廷赐予他五品顶戴，虽然远不及他之前的显赫地位，但这至少表明他在某种程度上仍被认可。
最终，在经历了数年的政治边缘化之后，穆彰阿于1856年病逝，享年七十五岁。
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