四、任职直隶
嘉庆六年（1801年），陈大文调任直隶，并被授予署理直隶总督的重任。直隶作为清朝的京畿之地，其重要性不言而喻。然而，陈大文刚刚履新之际，就面临着一场突如其来的自然灾害——京畿一带发生了严重的水灾，给当地百姓的生活造成了极大困扰。
面对这场天灾，陈大文没有丝毫犹豫，立即采取了一系列紧急措施。他首先向朝廷汇报了灾情，并请求拨发救灾款项。考虑到灾情的严重性以及灾区人民迫切需要救援的情况，陈大文在奏折中特别强调了快速行动的重要性。在他的强烈要求下，嘉庆帝做出了迅速反应，决定比原计划提前一个月向受灾地区发放赈灾银两，以便尽快帮助受灾群众渡过难关。
在抗灾过程中，陈大文不仅注重物质援助，还加强了对救灾工作的监管。他亲自巡视灾区，检查各项救灾措施是否落实到位，并对那些在防洪救灾时工作不力、玩忽职守的官员进行了严厉问责。特别是针对大城县和新城县两位知县的不作为行为，陈大文果断地提出了弹劾，并要求彻查此事。此举不仅有效地提高了救灾效率，还起到了警示作用，促使其他官员更加尽职尽责。
然而，长期的高强度工作让陈大文的身体不堪重负。到了嘉庆七年（1802年），由于长时间的劳累，陈大文健康状况急剧恶化，不得不在任上养病。鉴于陈大文在直隶总督任内的出色表现，嘉庆帝对他的病情表示了深切关怀，并命令其进京休养。同时，皇帝还安排了新的职务给他，包括担任吏部侍郎和工部尚书等重要职位，希望陈大文能在恢复健康的同时，继续为国效力。
五、江南治河
嘉庆八年（1803年），江南地区遭遇了罕见的连续降雨天气，导致长江和黄河水位急剧上升，沿岸堤坝频频告急。面对如此严峻的防汛形势，陈大文临危受命，再度离开京城，出任两江总督，肩负起治理水患、保护民众生命财产安全的重大责任。
一上任，陈大文即刻着手应对眼前的危机。他深知，要有效应对洪涝灾害，首先需要充足的物资支持。为此，陈大文亲自前往江苏、江西两地的仓库进行实地考察，却发现库存粮食和银两存在大量短缺。这一发现不仅暴露了地方财政的漏洞，也揭示了某些官员的腐败行为。面对这种情况，陈大文当即下令，要求相关省份必须在限定时间内弥补亏空，并严肃 追 查 责任人的法律责任。
与此同时，陈大文还加强了对地方官员的监督和考核。在江苏，他发现部分官员涉嫌贪污公款，严重影响了抗洪救灾工作的进展。对此，陈大文毫不手软，坚决惩治了这些贪官污吏，以此来肃清官场风气，确保抗洪救灾资金能够真正用于急需之处。
在处理这些案件的过程中，陈大文不仅展现出了强硬的一面，同时也表现出了他对法律的尊重和对正义的追求。例如，在安徽，他得知按察使珠隆阿在办理一起案件时，由于草率行事导致多名无辜百姓受到牵连。陈大文立即介入，经过仔细审查，证实了珠隆阿的行为确实存在重大失误。为此，他毅然决定弹劾罢免珠隆阿，并积极帮助受害百姓洗脱冤屈，恢复名誉。
陈大文的这一系列举措，不仅有效缓解了江南地区的水患危机，还为当地百姓伸张了正义。他的公正无私、雷厉风行的作风赢得了广泛的赞誉。清廷对此给予了高度评价，特地下旨表彰陈大文，肯定了他在维护法律尊严、保障人民权益方面所做的贡献，并号召全国各地的督抚向他学习
六、晚年
嘉庆十年（1805年），陈大文被擢升为兵部尚书，这是对他多年勤勉工作的肯定。然而，正当他准备迎接新的挑战之际，健康状况却出现了严重问题。在赴任途中，陈大文突感不适，病势日重。得知此消息后，嘉庆帝高度重视，立即派遣御医随侍卫一同前往救治，希望能够挽留这位忠心耿耿的臣子。尽管御医尽全力施救，但陈大文的病情并未得到明显好转。
鉴于陈大文的病情，嘉庆帝特许其携带尚书的官职标志回家乡调养身体，体现了皇帝对其的关怀与体恤。然而，陈大文的健康状况并没有随着休养而有所改善，反而日趋恶化。在此期间，他因之前在直隶总督任内未能及时察觉下属侵吞公款的行为而被革职，职务被降至四品京堂级别，且仅限于录用状态。这对陈大文来说无疑是沉重的打击，他从此深居简出，不再参与任何公共事务。
嘉庆二十年（1815年），陈大文在家中安详离世，享年七十三岁。
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