在拿下三巴桥后，岳钟琪并未停止前进的脚步，而是继续向拉萨推进。他巧妙地捉拿了被称为“万人敌”的叛军猛将黑喇嘛，并攻下了拉萨的门户喇哩。然而，正当岳钟琪准备乘胜追击时，却收到了来自青海的十四阿哥胤禵下达的暂停攻击的命令。面对这一情况，岳钟琪心急如焚，多次向噶尔弼建议迅速行动，以免错失战机。
最终，岳钟琪的建议被采纳，噶尔弼下令大军快速向拉萨挺进，岳钟琪再次担任先锋。经过连续几天的昼夜兼程，岳钟琪率领的部队于康熙五十九年（1720年）八月十九日抵达噶尔濯木鲁，并成功强渡河流，攻破敌堡，歼灭了准噶尔军，逼近拉萨山城。藏王达克咱闻讯后，率领地方政教官员出城迎接清军，岳钟琪则立即部署兵力，稳定局势，抓捕了准噶尔军在拉萨的内应喇嘛四百余名，迫使七千余名协助准噶尔军的藏兵投降。
此次战役中，岳钟琪以其出色的军事才能和灵活的战术运用，成功地平定了拉萨的叛乱，挫败了准噶尔策妄阿喇布坦的阴谋。岳钟琪的表现赢得了噶尔弼的高度评价，并为他赢得了康熙帝的嘉奖。康熙六十年（1721年）春，岳钟琪因功被晋升为左都督，并在五月被提升为四川提督，获赐孔雀花翎，表彰其在平定叛乱中的卓越贡献。
三、速平叛乱
康熙六十年（1721年）十月，青海辖境内的索罗木地区爆发了一场由郭罗克（今青海果洛藏族自治州）上中下三部落联合发动的反清叛乱。面对这一突发状况，康熙帝迅速做出反应，命令岳钟琪率军征讨叛军，平息事态。
岳钟琪接到圣旨后，立即着手组织兵力，督率瓦斯、杂谷等地土司所辖土兵，从松藩出发，向叛乱地区挺进。郭罗克一带地势险峻，山高林密，不利于骑兵行动。鉴于此，岳钟琪调整了作战方案，命令部队放弃马匹，改为徒步行军，以便更好地适应山区作战。
岳钟琪首先将目标锁定在下郭罗克，这里地形复杂，叛军据险而守，试图以此来抵御清军的攻势。然而，岳钟琪指挥下的清军凭借着良好的训练和严密的组织，成功击败了数千叛军，攻取了下郭罗克所属的吉宜卡等二十一座石碉寨。
在取得初步胜利后，岳钟琪没有给叛军喘息的机会，随即命令部队乘胜追击，向中郭罗克发起进攻。经过一天的激战，清军再度告捷，攻陷了中郭罗克的纳务等大小寨堡十九座，消灭了三百多名敌人，并俘获了叛军首领酸他尔奔等人。
清军士气高昂，岳钟琪抓住战机，继续挥师北上，围攻上郭罗克的六个寨子。在强大的压力面前，叛军头目坦增选择临阵投降，而其余的二十二名叛军首领也被清军生擒。随着上郭罗克的平定，郭罗克上中下三部落的叛乱最终被彻底平息。
这场战役中，岳钟琪采取了灵活的战术，包括“以番攻番”、根据地形特点调整作战方式等策略，实现了速战速决的目标。从出兵到胜利，整个过程仅仅历时七十多天，彰显了岳钟琪卓越的军事指挥才能。康熙帝得知捷报后，非常高兴，授予岳钟琪拜他喇布勒哈番（即骑都尉）的世职，以表彰他的功绩。
紧接着，在康熙六十一年（1722年），岳钟琪继续执行平叛任务，讨伐羊峒番。在成功平定该地区后，岳钟琪着眼于长远治理，建议设立南坪营（今四川九寨沟县），以加强对这一地区的管理和防御，确保边疆的安全稳定。
四、万里西征
雍正元年（1723年），青海蒙古和硕特部的台吉罗卜藏丹津发动叛乱，集结了吹克诺木齐、阿尔布坦温布、藏巴扎布等大小台吉，聚集了十余万兵马，侵犯西北边陲重镇西宁，并劫持了亲王察尔罕丹津，甚至杀害了朝廷派去调停的钦差大臣。面对这一严重的边境危机，雍正帝决定采取果断行动，任命川陕总督年羹尧为抚远大将军，岳钟琪为征西副将军、参赞大臣，共同率领大军西征。
岳钟琪接到命令后，于同年十一月三日率领六千精锐部队从松藩出发，沿甘南直扑青海。在行军途中，岳钟琪采取了灵活的战术，对于愿意归顺的部落进行招抚，对于顽抗到底的部落则坚决予以打击。十二月初十，岳钟琪驻扎在归德堡，并安抚了上寺东策卜、下寺东策卜等番部。随后，他率军连夜奔袭敦策卜，仅用不到半天时间便攻破了二十七个堡寨，歼灭数千敌人。
紧接着，呈库、果密、和尔嘉、沙密等部落（今青海共和、兴海一带）集结流散武装，占据了大石山。岳钟琪率部前往大石山隘口，叛军见状立刻组织防御。岳钟琪利用夜间进行战术调整，分左中右三路突袭叛军阵地，成功切断了叛军的退路，并取得了战斗的胜利。
雍正二年（1724年），岳钟琪被晋升为奋威将军。当年羹尧部抵达西宁时，罗卜藏丹津的主力已经将西宁城围困。二月二十六日，岳钟琪率六千铁骑赶到西宁城外，看到罗卜藏丹津正猛烈攻城，便指挥大军冲向敌阵，打得敌军溃不成军。年羹尧见状，立即命令城内清军全力出击，内外夹击之下，罗卜藏丹津的军队大败，仅带着少数骑兵逃走。
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