三、率军入关
顺治元年（1644年）四月初九日，多铎与阿济格随同睿亲王多尔衮率领满洲、蒙古兵力的三分之二以及汉军将领孔有德、耿仲明、尚可喜等人的部队，从盛京（今辽宁沈阳）出发，向山海关进军，准备进入中原地区。
当清军抵达辽河时，收到了明辽东总兵吴三桂的副将杨坤带来的消息，得知李自成的大顺军已经攻占北京，崇祯皇帝自缢身亡。吴三桂请求清军援助，希望借助清军的力量对抗李自成的大顺军。多尔衮随即命令多铎与阿济格率领军队快速赶往山海关。
四月二十一日黄昏，清军在距离山海关十五里外的地方驻扎下来。到了四月二十六日，清军推进到距离山海关外十里处，在一片石（今河北抚宁县东北九门口村）击败了大顺军唐通的部队。吴三桂趁机炮轰大顺军，亲自率领数百骑兵来到清军营地，拜见多尔衮，并剃发表示归顺。
随后，吴三桂作为前锋，带领清军进入山海关。英亲王阿济格率领一万骑兵作为左翼，多铎率领一万骑兵作为右翼，多尔衮则亲自率领主力军居后。清军与吴三桂的部队汇合后，总共拥有约十八万精兵，并占据了山海关的优势地形。
顺治元年（1644年）四月三十日晚，清军主力抵达蓟县（今天津市蓟州区），此时得知李自成的大顺军已经撤出了北京。多尔衮随即命令多铎与阿济格率领八旗精锐部队绕过北京，尾随追击大顺军。多尔衮则带着一部分精兵直接前往北京。
多铎与阿济格率军一路追击大顺军，直至追至固关（属山西省平定县），才停止追击返回北京。这一系列行动标志着清朝正式进入中原，并开始了对明朝残余势力的征服。随着清军的顺利进军，中原大地上的权力格局发生了重大变化，为清朝统一中国奠定了基础。
四、灭顺南征
顺治元年（1644年）十月初一，多铎晋升为亲王，并被授予定国大将军的称号，统领大军南征。当时，清朝为了消灭位于西安的大顺政权和位于南京的南明弘光政权，派遣了两路大军：一路由英亲王阿济格、吴三桂和尚可喜统率，目标是首先攻占陕北，随后南下西安；另一路由多铎率领，包括明朝降将孔有德、耿仲明等人，目标是进军南京，平定东南地区。
然而，就在两路大军离开北京之际，大顺军的两万余人东渡黄河，连续攻占了济源、孟县等地，并围攻了怀庆府城沁阳。面对这一突发情况，多尔衮下令多铎改变原定计划，先救援怀庆，然后进攻潼关，与阿济格会师西安。多铎迅速调整部署，率领部队推进到潼关附近，迫使大顺军陷入被动。
顺治元年（1644年）正月十二日，多铎的部队占领了潼关，并迅速推进到西安。顺治二年（1645年）二月，多尔衮命令英亲王阿济格留在关中，负责追剿李自成，而豫亲王多铎则继续率领其部下向南进发，承担平定江南的任务。
二月十四日，多铎奉命率领大军 回 师 东征，抵达河南。三月初九日，多铎的大军出虎牢关，并分兵由龙门、南阳三路合围归德。在攻陷归德后，多铎的八旗大军继续横扫河南大部分地区，许多州县纷纷归降。在河南战场上，多铎的大军连连取得胜利。
清廷得知多铎在中原地区的战绩，特别下诏表彰他的功绩，赐予他嵌珠佩刀和镀金鞋带作为奖励。
五、平定江南
顺治二年（1645年）四月二十五日，多铎率领清军攻占了扬州，杀死了南明督师史可法，并制造了着名的“扬州十日”屠杀事件。此次屠杀事件是清军在南征过程中最为血腥的一幕，造成了数以万计的平民死亡。扬州的沦陷标志着清军对南明政权的重大打击。
占领扬州之后，多铎并未立即南下，而是选择陈兵江北，直到五月初九日才占领了镇江。镇江的失陷为清军南下打开了门户，使他们能够更轻松地进入南京。五月十六日，多铎率军进入了南京，这座曾是明朝的首都。
为了安抚明朝遗民，多铎发布了一系列通告，宣称清军的南征是为了“奉天伐罪，救民水火”，并且颁布禁令禁止民众强制性地穿戴满族服饰或剃发。多铎还下令在扬州建立史可法祠，以表彰史可法的忠贞节烈，同时他还亲自拜谒了明孝陵，并对“明太子”表现出极大的尊敬。这些举动旨在展现清军并非野蛮侵略者，而是以仁义之师自居。
多铎警告南明的官员和民众，如果他们抵抗清军，将会遭受与扬州同样的命运。五月二十八日，多铎前往南京的报恩寺上香，他的出现引发了当地市民的好奇和围观，甚至有人因拥挤而丧命。
在平定了南京之后，多铎派遣贝勒尼堪、贝子屯济等将领率军追击南明弘光帝至太平，并成功生擒了弘光帝。六月初，他又派遣贝勒博洛等将领前往杭州，击败了大学士马士英，并迫使潞王朱常淓投降。淮王朱常清也从绍兴前来投降。这样一来，浙东和浙西地区完全落入清军的控制之中。
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