在处理与俺答的关系上，王崇古展现了非凡的政治智慧。起初，俺答的部众曾越过甘肃侵扰西部少数民族，但王崇古通过书信劝阻，俺答亦回信认错。当俺答的从孙切尽台吉请求支援西部战线时，王崇古上奏建议朝廷应警惕俺答的真实意图，同时加强边防，暗中告知西部少数民族俺答的计划，以此彰显恩惠，分化敌对势力。
王崇古的外交策略引起了朝中一些官员的不满。刘铉、彭应时、南京御史陈堂等人接连批评他过于放松边防，便利敌人。面对质疑，王崇古 上 疏 辩解并提出辞呈。明神宗再次展现对他的信任，下达慰勉诏书，指示他不必理会攻击。尽管如此，给事中尹瑾、御史高维崧继续弹劾，王崇古最终选择引退，明神宗准许其告老还乡。
王崇古的退休并未影响他在皇帝心中的地位。万历十五年，鉴于他三次成功促成与北方部落的封贡，明神宗特地下诏，荫庇其子为锦衣千户，并命有司按礼节慰问。一年后，王崇古逝世，朝廷追赠他为太保，谥号“襄毅”，以表彰其一生功绩。
结语
王崇古的一生，是明朝边疆历史的缩影。他不仅是一位英勇的将领，更是一位睿智的政治家，通过军事和外交的双重手段，维护了国家的安宁。他的故事，如同长城上空翱翔的雄鹰，永远激励着后来者，成为中华民族边防史上不可磨灭的传奇。
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