吕宋岛西南部的三描礼士山脉（Zambales Mountains）有丰富的铬铁矿，已开采的铬铁矿有62个，其中位于圣克鲁斯（Santa Cruz）南东约16公里的阿科杰（Acoje）铬铁矿，储量348万吨，是菲律宾最大的冶金级铬铁矿；位于马辛洛克（Masinloc）地区的科托（Coto）铬铁矿，储量530万吨，是菲律宾最大的耐火级铬铁矿。
吕宋岛的铁矿主要集中在三描礼士山、比科尔半岛北部的庞阿尼班（Panganniban）、邦多克半岛（Bondoc Peninsula）的穆拉奈（Mulanay）地区。吕宋岛铁矿的缺点含硫量、含硅量比较高，硫品位大多在4％左右，二氧化硅含量在20％左右，选矿、炼铁时成本会增加，不过吕宋岛铁矿也有优点，那就是矿石中大多含铜、金、银。比科尔半岛已探明的铁矿储量在1.5亿吨左右，这些铁矿的上半部为铁矿，下半部却是铜金矿。如庞阿尼班西部半岛有个拉拉普（Larap）铁矿（与巴拉贡金矿相邻），1833年就开采铁矿，到1975年闭矿时共开采了1.4亿吨铁矿石，后来发现铁矿体的下盘竟然有厚大的铜、钼矿体，伴生金、银，2010年中国某公司接手时，铁矿石保有储量782万吨，尽管铁品位只有23.8％，但伴生的铜储量11.26万吨、品位0.48％，钼储量1.4万吨、品位0.07％，钴储量4600吨、品位0.015％，黄金储量9.8吨、品位0.3克/吨，银储量42.23吨、品位1.8克/吨，另外矿区还有20多吨的砂金矿，该公司买下这个铁矿后，仅开产砂金矿，就能赚大钱，从中也看出菲律宾人的探矿能力有多差！庞阿尼班西南2.5公里有个杜马口（Domaco）铁矿，1935年发现，1939年开采，矿石量约1000万吨，铁品位40％左右、铜品位0.32％，该铁矿的东北沿海就是巴拉贡金矿。拉拉普铁矿附近还有阿古桑铁矿（矿石量3140万吨）、033铜矿、085岩金矿（储量3.56吨）、085砂金矿（黄金储量50吨）、318铜钼矿（矿石量9000万吨，铜品位0.24％，钼品位0.024％）、066铅锌矿（铅锌储量31.3万吨、铜储量6.7万吨、黄金储量2.97吨）、贝塞默铜钼矿（铜储量7.1万吨、钼储量1.5万吨）。穆拉奈的铁矿也是个大型铁矿，1956年发现，分东、西两个矿段，矿石量在1亿吨左右。在吕宋岛西北部帕苏金（Pasuquin）沿海的沙滩里还有数千万吨的磁铁矿砂，埋于水面下7米，开挖这种铁矿砂时，可以直接用磁选，可省去采矿、破碎、球磨等工序。
吕宋岛马尼拉东南部的安蒂波洛（Antipolo）有汞矿，该矿于1955年开采，1976年因环保原因闭矿。
吕宋岛上的非金属矿产也极为丰富，主要是石灰石、白云石，仅马尼拉周边就有很多石灰石矿，如马尼拉东北的罗德里格斯（Rodriguez）、圣何塞·德尔蒙特（San Jose del Monte）就有很多采石场，开采石灰石、花岗石、大理石、白云石。吕宋岛也有磷矿、煤矿，如南部的八打雁地区就有磷矿，煤矿主要分布在东部的马德雷山（有8个煤矿）、林加延湾东部的罗萨里奥（Rosario）地区（有2个煤矿）、东南部的比科尔半岛（有2个煤矿），在吕宋岛南部的卢塞纳（Lucena）、阿格丹甘（Agdangan）各有1个煤矿。不过，吕宋岛上的煤矿都是中小型煤矿。
波利略岛，位于吕宋岛东，面积约615平方公里，岛上有小型金矿、铅锌矿、煤矿。
卡坦端内斯岛，位于吕宋岛比科尔半岛东，面积约1460平方公里，岛上有小型金矿、银矿、锰矿、磷矿、煤矿、大理石矿。
卡格拉赖岛，位于吕宋岛比科尔半岛阿尔拜湾北部，面积约80平方公里，岛上有4个小型煤矿。
位于吕宋岛比科尔半岛阿尔拜湾东部的拉普拉普岛，面积约70平方公里，岛的南部有希克斯巴（Hixbar）露天铜金矿，铜储量8.76万吨，锌储量14万吨，黄金储量18吨，银储量220吨。
民都洛岛（麻逸岛），被西班牙人于16世纪占领后不久就发现了金矿，因此被西班牙改名为“Mindoro”（民都洛）岛，取名来自于西班牙文的“Mina de Oro”，即“金矿”之意。民都洛岛有金矿、铜矿、镍矿、煤矿。砂金矿主要位于东北部的卡拉潘（Calapan）地区，岩金矿主要位于哈尔孔山（Halcon）；铜矿主要位于岛的西部地区，如Amnay地区就有铜锌矿；镍矿位于中部的卡拉姆潘（Calampuan）地区，已探明的矿石量达2.25亿吨，镍品位0.94％、钴品位0.07％；煤矿主要位于岛的南部，如芒阿林湾（Mangarin湾）沿岸就有很多煤矿。
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