学成仙术的鸣人回到了木叶之后，接连打败了佩恩六道中的五人，不过，在与天道交战中，由于目睹了雏田为保护自己而重伤，导致体内的九尾暴走了。
当九尾的第八条尾巴从封印中解放的时候，四代火影波风水门出现在了鸣人的精神世界，阻止了九尾。因为波风水门死前，波风浩人将自己的查克拉改变性质后传递给了波风水门和漩涡玖辛奈，因此，波风水门能和漩涡鸣人聊更长的时间。
“无论何时，父母总是会相信自己的孩子啊。。。。对了，鸣人，你知道木叶鬼才波风浩人吗？”波风水门说道。
“恩恩，我知道，他是克隆技术和仙法之印的创造者，我从三代火影爷爷和卡卡西老师口中得知，他是一位很伟大的忍者，为了村子牺牲了自己的生命，据说，他死亡的时候才十岁。”漩涡鸣人说道。
“木叶鬼才，波风浩人，他是你的亲哥哥。”波风水门说道。
“什么？。。。我的亲哥哥？我有。。。哥哥？”漩涡鸣人惊讶的说道。
“没错，他是你的哥哥。。。浩人是木叶有史以来最天才的忍者，我本以为他会成为木叶的火影，没有想到，在我死后才两年时间，浩人就失去了生命。”波风水门在漩涡鸣人体内可以看到鸣人经历过的一切，因此知道了波风浩人死亡的事情，“你的八卦封印被浩人打开了一个缺口，在缺口处，浩人布置了一个复杂的封印，因为这个封印的存在，九尾的力量不断的强化着你的身体，这就是你的身体素质为什么那么强大的原因。。。。这个封印名为“补偿封印”，是浩人对你的补偿。”
“哥哥。。。对我的。。。。补偿？”鸣人奇怪的问道。
“恩，你是九尾人柱力，为了让你才能够战胜九尾、控制九尾，浩人让三代火影大人隐藏了你的身世。。。。只有经历最黑暗的人生，才能看到最细微的光明，浩人这么做是为了让你拥有一颗强大的内心。。。。不要怪浩人，鸣人。”波风水门拍了拍漩涡鸣人的头说道。
“原来是这样。。。。我怎么。。。我怎么会怪哥哥呢。”漩涡鸣人擦拭着脸上的眼泪说道：“一直以来，一直以来，我都不知道什么是爱，也没有感受到过爱。。。。直到现在我才知道，在我出生的时候，我就被爱包裹着了。。。。这样的感觉。。。真的。。。真的。。。真的。。。很好。”
“你能这么想。。。。真是太好了，鸣人。”波风水门笑着说道，“鸣人，接下来，我要告诉你当年你出生的那天发生的所有事情，认真听。。。”
“嗯，知道了，爸爸。”漩涡鸣人点了点头说道。
四代火影将鸣人出生那晚，所有的一切都详细的告诉了鸣人。
“你在控制九尾的时候，就可以见到妈妈了，好好努力吧，鸣人。。。。我也该走了，查克拉快用完了，我把封印重新复原，但这是最后一次了。”说着，波风水门伸手将漩涡鸣人腹部的八卦封印修复了，波风浩人布置的“补偿封印”没有一点的削弱，因此并不需要修复，“木叶还可以重建，拜托你了哦，鸣人。”
“谢谢你，爸爸。”看着父亲消失的地方，鸣人的内心变的非常的充实。得知了一切的鸣人，内心的空洞已经被父亲、母亲还有哥哥的爱所填满。
之后，鸣人重新回到了战场，打倒了佩恩天道。并找到了长门所在的位置，说服长门重新找回了昔日的理想，长门施展轮回天生之术让包括卡卡西在内的已经牺牲的木叶村人们复活，自己也因此而死去。鸣人由于保护了村子而成为了英雄，得到木叶村所有人的景仰。
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